Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sept1P42209 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sept1P42209 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sept1P42209 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sept1P42209 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sept1P42209 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sept1P42209 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sept1P42209 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sept1P42209 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sept1P42209 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Sept1P42209 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sept1P42209 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sept1P42209 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sept1P42209 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sept1P42209 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sept1P42209 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sept1P42209 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sept1P42209 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sept1P42209 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Sept1P42209 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sept1P42209 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sept1P42209 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sept1P42209 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sept1P42209 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sept1P42209 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sept1P42209 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Sept1P42209 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Sept1P42209 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sept1P42209 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sept1P42209 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sept1P42209 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sept1P42209 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sept1P42209 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sept1P42209 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sept1P42209 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sept1P42209 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sept1P42209 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sept1P42209 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sept1P42209 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sept1P42209 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sept1P42209 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sept1P42209 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sept1P42209 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sept1P42209 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sept1P42209 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sept1P42209 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sept1P42209 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sept1P42209 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sept1P42209 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Sept1P42209 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sept1P42209 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sept1P42209 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sept1P42209 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sept1P42209 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sept1P42209 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sept1P42209 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sept1P42209 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sept1P42209 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sept1P42209 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sept1P42209 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Sept1P42209 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sept1P42209 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sept1P42209 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sept1P42209 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sept1P42209 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sept1P42209 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sept1P42209 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sept1P42209 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sept1P42209 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sept1P42209 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sept1P42209 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sept1P42209 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sept1P42209 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sept1P42209 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sept1P42209 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sept1P42209 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sept1P42209 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sept1P42209 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sept1P42209 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sept1P42209 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sept1P42209 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sept1P42209 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sept1P42209 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sept1P42209 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sept1P42209 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sept1P42209 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sept1P42209 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sept1P42209 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sept1P42209 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sept1P42209 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sept1P42209 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sept1P42209 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sept1P42209 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sept1P42209 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sept1P42209 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sept1P42209 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Sept1P42209 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sept1P42209 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Sept1P42209 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sept1P42209 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms