Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PpargP37238 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PpargP37238 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PpargP37238 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PpargP37238 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PpargP37238 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PpargP37238 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PpargP37238 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PpargP37238 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PpargP37238 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PpargP37238 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PpargP37238 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PpargP37238 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PpargP37238 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PpargP37238 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PpargP37238 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PpargP37238 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PpargP37238 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PpargP37238 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PpargP37238 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PpargP37238 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PpargP37238 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PpargP37238 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PpargP37238 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PpargP37238 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PpargP37238 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PpargP37238 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PpargP37238 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PpargP37238 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PpargP37238 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PpargP37238 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PpargP37238 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PpargP37238 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PpargP37238 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PpargP37238 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PpargP37238 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PpargP37238 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PpargP37238 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PpargP37238 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PpargP37238 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PpargP37238 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PpargP37238 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PpargP37238 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PpargP37238 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PpargP37238 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PpargP37238 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PpargP37238 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PpargP37238 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PpargP37238 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PpargP37238 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PpargP37238 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PpargP37238 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PpargP37238 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PpargP37238 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PpargP37238 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PpargP37238 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PpargP37238 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PpargP37238 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PpargP37238 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PpargP37238 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PpargP37238 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PpargP37238 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PpargP37238 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PpargP37238 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PpargP37238 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PpargP37238 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PpargP37238 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PpargP37238 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PpargP37238 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PpargP37238 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PpargP37238 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PpargP37238 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PpargP37238 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PpargP37238 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PpargP37238 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PpargP37238 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PpargP37238 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PpargP37238 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PpargP37238 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PpargP37238 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PpargP37238 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PpargP37238 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PpargP37238 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PpargP37238 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PpargP37238 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PpargP37238 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PpargP37238 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PpargP37238 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PpargP37238 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PpargP37238 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PpargP37238 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PpargP37238 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PpargP37238 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PpargP37238 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PpargP37238 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PpargP37238 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PpargP37238 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PpargP37238 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PpargP37238 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PpargP37238 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.9 ms