Protein–RNA interactions for Protein: P35917

Flt4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt4P35917 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Flt4P35917 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Flt4P35917 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Flt4P35917 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Flt4P35917 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Flt4P35917 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Flt4P35917 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Flt4P35917 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Flt4P35917 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Flt4P35917 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Flt4P35917 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Flt4P35917 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Flt4P35917 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Flt4P35917 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Flt4P35917 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Flt4P35917 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Flt4P35917 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Flt4P35917 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Flt4P35917 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Flt4P35917 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Flt4P35917 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Flt4P35917 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Flt4P35917 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Flt4P35917 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Flt4P35917 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Flt4P35917 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Flt4P35917 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Flt4P35917 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Flt4P35917 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Flt4P35917 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Flt4P35917 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Flt4P35917 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Flt4P35917 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Flt4P35917 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Flt4P35917 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Flt4P35917 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Flt4P35917 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Flt4P35917 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Flt4P35917 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Flt4P35917 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Flt4P35917 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Flt4P35917 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Flt4P35917 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Flt4P35917 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Flt4P35917 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Flt4P35917 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Flt4P35917 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Flt4P35917 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Flt4P35917 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Flt4P35917 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Flt4P35917 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Flt4P35917 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Flt4P35917 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Flt4P35917 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Flt4P35917 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Flt4P35917 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Flt4P35917 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Flt4P35917 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Flt4P35917 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Flt4P35917 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Flt4P35917 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Flt4P35917 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Flt4P35917 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Flt4P35917 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Flt4P35917 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Flt4P35917 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Flt4P35917 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Flt4P35917 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Flt4P35917 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Flt4P35917 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Flt4P35917 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Flt4P35917 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Flt4P35917 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Flt4P35917 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Flt4P35917 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Flt4P35917 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Flt4P35917 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Flt4P35917 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Flt4P35917 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Flt4P35917 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Flt4P35917 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Flt4P35917 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Flt4P35917 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Flt4P35917 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Flt4P35917 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Flt4P35917 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Flt4P35917 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Flt4P35917 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Flt4P35917 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Flt4P35917 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Flt4P35917 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Flt4P35917 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Flt4P35917 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Flt4P35917 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Flt4P35917 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Flt4P35917 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Flt4P35917 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Flt4P35917 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Flt4P35917 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Flt4P35917 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms