Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp12P34960 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp12P34960 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp12P34960 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp12P34960 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp12P34960 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp12P34960 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp12P34960 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp12P34960 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp12P34960 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp12P34960 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp12P34960 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp12P34960 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp12P34960 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp12P34960 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp12P34960 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp12P34960 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp12P34960 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mmp12P34960 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp12P34960 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp12P34960 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp12P34960 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mmp12P34960 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mmp12P34960 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mmp12P34960 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mmp12P34960 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mmp12P34960 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mmp12P34960 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms