Protein–RNA interactions for Protein: P32507

Nectin2, Nectin-2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin2P32507 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nectin2P32507 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nectin2P32507 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nectin2P32507 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nectin2P32507 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nectin2P32507 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nectin2P32507 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nectin2P32507 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nectin2P32507 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nectin2P32507 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nectin2P32507 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nectin2P32507 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nectin2P32507 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Nectin2P32507 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nectin2P32507 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nectin2P32507 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nectin2P32507 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nectin2P32507 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nectin2P32507 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nectin2P32507 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nectin2P32507 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nectin2P32507 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Nectin2P32507 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nectin2P32507 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Nectin2P32507 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nectin2P32507 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nectin2P32507 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nectin2P32507 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Nectin2P32507 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nectin2P32507 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nectin2P32507 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nectin2P32507 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nectin2P32507 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nectin2P32507 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nectin2P32507 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nectin2P32507 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nectin2P32507 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nectin2P32507 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nectin2P32507 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nectin2P32507 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nectin2P32507 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nectin2P32507 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nectin2P32507 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nectin2P32507 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nectin2P32507 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Nectin2P32507 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nectin2P32507 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nectin2P32507 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nectin2P32507 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nectin2P32507 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nectin2P32507 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nectin2P32507 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nectin2P32507 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nectin2P32507 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nectin2P32507 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nectin2P32507 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nectin2P32507 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Nectin2P32507 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nectin2P32507 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nectin2P32507 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nectin2P32507 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nectin2P32507 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nectin2P32507 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nectin2P32507 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nectin2P32507 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nectin2P32507 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nectin2P32507 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nectin2P32507 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nectin2P32507 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nectin2P32507 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nectin2P32507 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nectin2P32507 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nectin2P32507 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nectin2P32507 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nectin2P32507 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nectin2P32507 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nectin2P32507 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nectin2P32507 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nectin2P32507 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nectin2P32507 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nectin2P32507 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nectin2P32507 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nectin2P32507 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nectin2P32507 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nectin2P32507 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nectin2P32507 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nectin2P32507 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nectin2P32507 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nectin2P32507 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nectin2P32507 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nectin2P32507 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nectin2P32507 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Nectin2P32507 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Nectin2P32507 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nectin2P32507 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nectin2P32507 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nectin2P32507 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nectin2P32507 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nectin2P32507 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nectin2P32507 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.8 ms