Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OatP29758 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OatP29758 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OatP29758 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OatP29758 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OatP29758 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OatP29758 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OatP29758 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
OatP29758 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OatP29758 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OatP29758 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OatP29758 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OatP29758 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
OatP29758 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OatP29758 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
OatP29758 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
OatP29758 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OatP29758 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OatP29758 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OatP29758 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OatP29758 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OatP29758 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
OatP29758 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OatP29758 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OatP29758 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OatP29758 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
OatP29758 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
OatP29758 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
OatP29758 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OatP29758 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OatP29758 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OatP29758 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OatP29758 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OatP29758 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OatP29758 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OatP29758 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OatP29758 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OatP29758 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OatP29758 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OatP29758 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OatP29758 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OatP29758 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OatP29758 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
OatP29758 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OatP29758 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OatP29758 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OatP29758 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OatP29758 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OatP29758 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OatP29758 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OatP29758 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OatP29758 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OatP29758 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OatP29758 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OatP29758 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OatP29758 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OatP29758 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OatP29758 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OatP29758 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
OatP29758 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OatP29758 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
OatP29758 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OatP29758 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OatP29758 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OatP29758 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OatP29758 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OatP29758 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OatP29758 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OatP29758 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OatP29758 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
OatP29758 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
OatP29758 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OatP29758 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OatP29758 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OatP29758 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OatP29758 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OatP29758 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OatP29758 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OatP29758 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
OatP29758 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OatP29758 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OatP29758 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OatP29758 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OatP29758 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OatP29758 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OatP29758 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OatP29758 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OatP29758 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OatP29758 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
OatP29758 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OatP29758 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OatP29758 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
OatP29758 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
OatP29758 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
OatP29758 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OatP29758 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OatP29758 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OatP29758 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OatP29758 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
OatP29758 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms