Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc1P29341 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc1P29341 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc1P29341 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc1P29341 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc1P29341 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpc1P29341 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpc1P29341 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpc1P29341 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpc1P29341 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc1P29341 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc1P29341 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc1P29341 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc1P29341 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc1P29341 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc1P29341 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc1P29341 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc1P29341 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc1P29341 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc1P29341 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc1P29341 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc1P29341 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc1P29341 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc1P29341 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc1P29341 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc1P29341 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpc1P29341 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpc1P29341 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc1P29341 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc1P29341 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc1P29341 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc1P29341 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc1P29341 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc1P29341 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc1P29341 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc1P29341 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc1P29341 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc1P29341 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc1P29341 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc1P29341 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc1P29341 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc1P29341 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc1P29341 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc1P29341 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc1P29341 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc1P29341 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc1P29341 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc1P29341 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc1P29341 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc1P29341 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc1P29341 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc1P29341 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc1P29341 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc1P29341 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pabpc1P29341 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms