Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RxraP28700 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RxraP28700 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RxraP28700 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RxraP28700 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RxraP28700 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RxraP28700 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RxraP28700 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RxraP28700 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RxraP28700 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RxraP28700 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RxraP28700 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RxraP28700 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RxraP28700 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RxraP28700 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RxraP28700 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RxraP28700 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RxraP28700 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RxraP28700 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RxraP28700 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RxraP28700 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RxraP28700 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RxraP28700 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RxraP28700 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RxraP28700 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RxraP28700 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RxraP28700 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RxraP28700 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RxraP28700 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RxraP28700 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RxraP28700 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RxraP28700 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RxraP28700 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RxraP28700 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RxraP28700 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RxraP28700 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RxraP28700 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RxraP28700 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RxraP28700 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RxraP28700 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RxraP28700 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RxraP28700 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RxraP28700 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RxraP28700 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RxraP28700 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RxraP28700 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RxraP28700 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RxraP28700 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RxraP28700 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RxraP28700 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RxraP28700 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RxraP28700 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RxraP28700 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RxraP28700 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RxraP28700 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RxraP28700 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RxraP28700 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RxraP28700 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RxraP28700 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RxraP28700 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RxraP28700 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RxraP28700 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RxraP28700 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RxraP28700 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RxraP28700 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RxraP28700 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RxraP28700 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RxraP28700 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RxraP28700 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RxraP28700 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RxraP28700 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RxraP28700 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RxraP28700 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RxraP28700 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RxraP28700 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RxraP28700 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RxraP28700 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RxraP28700 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RxraP28700 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RxraP28700 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RxraP28700 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RxraP28700 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RxraP28700 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RxraP28700 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RxraP28700 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RxraP28700 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RxraP28700 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RxraP28700 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RxraP28700 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RxraP28700 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RxraP28700 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RxraP28700 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RxraP28700 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RxraP28700 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RxraP28700 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RxraP28700 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RxraP28700 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RxraP28700 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RxraP28700 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RxraP28700 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms