Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Marcksl1P28667 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Marcksl1P28667 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Marcksl1P28667 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Marcksl1P28667 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Marcksl1P28667 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Marcksl1P28667 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Marcksl1P28667 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Marcksl1P28667 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Marcksl1P28667 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Marcksl1P28667 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Marcksl1P28667 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Marcksl1P28667 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Marcksl1P28667 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Marcksl1P28667 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Marcksl1P28667 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Marcksl1P28667 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Marcksl1P28667 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Marcksl1P28667 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Marcksl1P28667 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Marcksl1P28667 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Marcksl1P28667 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Marcksl1P28667 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Marcksl1P28667 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Marcksl1P28667 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Marcksl1P28667 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Marcksl1P28667 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Marcksl1P28667 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Marcksl1P28667 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Marcksl1P28667 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Marcksl1P28667 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Marcksl1P28667 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Marcksl1P28667 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Marcksl1P28667 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Marcksl1P28667 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Marcksl1P28667 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Marcksl1P28667 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Marcksl1P28667 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Marcksl1P28667 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Marcksl1P28667 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Marcksl1P28667 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Marcksl1P28667 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Marcksl1P28667 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms