Protein–RNA interactions for Protein: P28660

Nckap1, Nck-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1P28660 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nckap1P28660 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nckap1P28660 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nckap1P28660 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nckap1P28660 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nckap1P28660 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nckap1P28660 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nckap1P28660 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nckap1P28660 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nckap1P28660 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nckap1P28660 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nckap1P28660 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nckap1P28660 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nckap1P28660 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nckap1P28660 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nckap1P28660 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nckap1P28660 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nckap1P28660 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nckap1P28660 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nckap1P28660 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nckap1P28660 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nckap1P28660 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nckap1P28660 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nckap1P28660 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nckap1P28660 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nckap1P28660 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nckap1P28660 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nckap1P28660 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nckap1P28660 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nckap1P28660 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nckap1P28660 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nckap1P28660 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nckap1P28660 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nckap1P28660 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nckap1P28660 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nckap1P28660 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nckap1P28660 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nckap1P28660 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nckap1P28660 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nckap1P28660 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nckap1P28660 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nckap1P28660 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nckap1P28660 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nckap1P28660 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nckap1P28660 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nckap1P28660 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nckap1P28660 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nckap1P28660 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nckap1P28660 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nckap1P28660 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nckap1P28660 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nckap1P28660 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nckap1P28660 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nckap1P28660 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nckap1P28660 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nckap1P28660 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nckap1P28660 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nckap1P28660 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nckap1P28660 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nckap1P28660 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nckap1P28660 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nckap1P28660 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nckap1P28660 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nckap1P28660 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nckap1P28660 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nckap1P28660 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nckap1P28660 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nckap1P28660 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nckap1P28660 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nckap1P28660 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nckap1P28660 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nckap1P28660 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms