Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd9P28357 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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