Protein–RNA interactions for Protein: P28236

Gja8, Gap junction alpha-8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja8P28236 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gja8P28236 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gja8P28236 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gja8P28236 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gja8P28236 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gja8P28236 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gja8P28236 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gja8P28236 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gja8P28236 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gja8P28236 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gja8P28236 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gja8P28236 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gja8P28236 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gja8P28236 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gja8P28236 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gja8P28236 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gja8P28236 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gja8P28236 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gja8P28236 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gja8P28236 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gja8P28236 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gja8P28236 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gja8P28236 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gja8P28236 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gja8P28236 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gja8P28236 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gja8P28236 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gja8P28236 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gja8P28236 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gja8P28236 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gja8P28236 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gja8P28236 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gja8P28236 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gja8P28236 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gja8P28236 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gja8P28236 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gja8P28236 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gja8P28236 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gja8P28236 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gja8P28236 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gja8P28236 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gja8P28236 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gja8P28236 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gja8P28236 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Gja8P28236 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gja8P28236 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gja8P28236 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gja8P28236 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gja8P28236 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gja8P28236 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gja8P28236 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gja8P28236 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gja8P28236 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gja8P28236 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gja8P28236 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gja8P28236 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gja8P28236 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gja8P28236 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gja8P28236 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gja8P28236 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gja8P28236 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gja8P28236 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gja8P28236 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gja8P28236 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gja8P28236 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gja8P28236 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gja8P28236 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gja8P28236 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gja8P28236 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gja8P28236 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gja8P28236 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gja8P28236 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gja8P28236 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gja8P28236 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gja8P28236 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gja8P28236 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gja8P28236 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gja8P28236 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gja8P28236 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gja8P28236 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gja8P28236 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gja8P28236 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gja8P28236 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gja8P28236 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gja8P28236 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gja8P28236 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gja8P28236 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gja8P28236 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gja8P28236 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gja8P28236 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gja8P28236 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gja8P28236 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gja8P28236 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gja8P28236 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gja8P28236 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gja8P28236 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gja8P28236 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gja8P28236 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gja8P28236 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gja8P28236 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms