Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pde6aP27664 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pde6aP27664 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pde6aP27664 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pde6aP27664 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pde6aP27664 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pde6aP27664 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pde6aP27664 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pde6aP27664 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pde6aP27664 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pde6aP27664 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pde6aP27664 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pde6aP27664 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pde6aP27664 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pde6aP27664 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pde6aP27664 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pde6aP27664 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pde6aP27664 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pde6aP27664 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pde6aP27664 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pde6aP27664 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pde6aP27664 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pde6aP27664 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pde6aP27664 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Pde6aP27664 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pde6aP27664 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pde6aP27664 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pde6aP27664 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pde6aP27664 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pde6aP27664 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pde6aP27664 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Pde6aP27664 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Pde6aP27664 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pde6aP27664 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pde6aP27664 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pde6aP27664 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pde6aP27664 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pde6aP27664 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pde6aP27664 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pde6aP27664 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pde6aP27664 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Pde6aP27664 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pde6aP27664 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pde6aP27664 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pde6aP27664 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pde6aP27664 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pde6aP27664 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pde6aP27664 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pde6aP27664 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pde6aP27664 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms