Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms