Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xrcc5P27641 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Xrcc5P27641 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Xrcc5P27641 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Xrcc5P27641 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms