Protein–RNA interactions for Protein: P26955

Csf2rb, Cytokine receptor common subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2rbP26955 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csf2rbP26955 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csf2rbP26955 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csf2rbP26955 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csf2rbP26955 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csf2rbP26955 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csf2rbP26955 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csf2rbP26955 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csf2rbP26955 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csf2rbP26955 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csf2rbP26955 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csf2rbP26955 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csf2rbP26955 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csf2rbP26955 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csf2rbP26955 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csf2rbP26955 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csf2rbP26955 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csf2rbP26955 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csf2rbP26955 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csf2rbP26955 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csf2rbP26955 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csf2rbP26955 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csf2rbP26955 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csf2rbP26955 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csf2rbP26955 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csf2rbP26955 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csf2rbP26955 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Csf2rbP26955 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csf2rbP26955 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csf2rbP26955 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csf2rbP26955 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csf2rbP26955 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csf2rbP26955 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csf2rbP26955 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csf2rbP26955 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csf2rbP26955 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csf2rbP26955 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csf2rbP26955 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csf2rbP26955 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csf2rbP26955 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Csf2rbP26955 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csf2rbP26955 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csf2rbP26955 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csf2rbP26955 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csf2rbP26955 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csf2rbP26955 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csf2rbP26955 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csf2rbP26955 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csf2rbP26955 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csf2rbP26955 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csf2rbP26955 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csf2rbP26955 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csf2rbP26955 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csf2rbP26955 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csf2rbP26955 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csf2rbP26955 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csf2rbP26955 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csf2rbP26955 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Csf2rbP26955 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csf2rbP26955 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Csf2rbP26955 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Csf2rbP26955 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csf2rbP26955 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csf2rbP26955 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csf2rbP26955 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csf2rbP26955 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Csf2rbP26955 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csf2rbP26955 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csf2rbP26955 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csf2rbP26955 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csf2rbP26955 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csf2rbP26955 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csf2rbP26955 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms