Protein–RNA interactions for Protein: P26687

Twist1, Twist-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist1P26687 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17,39■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,39■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,39■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,39■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
Twist1P26687 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17,38■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17,37■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,37■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Twist1P26687 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17,36■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17,36■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Twist1P26687 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,35■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17,35■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17,35■□□□□ 0,37
Twist1P26687 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,34■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,34■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,34■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,34■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17,34■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,33■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,33■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,33■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,33■□□□□ 0,37
Twist1P26687 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17,33■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,33■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17,33■□□□□ 0,36
Twist1P26687 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,33■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17,32■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,32■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17,32■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,32■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,32■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,32■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,32■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17,32■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,31■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,31■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,31■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,31■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17,31■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,31■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,31■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,31■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17,31■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,3■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,3■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,3■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,3■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,3■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,3■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,29■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17,29■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,29■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,29■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17,28■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17,28■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,28■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,28■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17,28■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,28■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,27■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,27■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,27■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,27■□□□□ 0,36
Twist1P26687 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,27■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,27■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,25■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17,25■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,25■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,25■□□□□ 0,35
Twist1P26687 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17,25■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17,24■□□□□ 0,35
Twist1P26687 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,24■□□□□ 0,35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28,2 ms