Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfkb1P25799 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfkb1P25799 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfkb1P25799 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfkb1P25799 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfkb1P25799 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfkb1P25799 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfkb1P25799 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfkb1P25799 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfkb1P25799 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfkb1P25799 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfkb1P25799 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfkb1P25799 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfkb1P25799 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfkb1P25799 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfkb1P25799 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfkb1P25799 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfkb1P25799 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfkb1P25799 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfkb1P25799 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfkb1P25799 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfkb1P25799 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nfkb1P25799 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nfkb1P25799 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfkb1P25799 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfkb1P25799 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfkb1P25799 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfkb1P25799 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfkb1P25799 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfkb1P25799 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfkb1P25799 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfkb1P25799 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfkb1P25799 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfkb1P25799 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfkb1P25799 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nfkb1P25799 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nfkb1P25799 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nfkb1P25799 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfkb1P25799 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfkb1P25799 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfkb1P25799 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfkb1P25799 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nfkb1P25799 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms