Protein–RNA interactions for Protein: P23819

Gria2, Glutamate receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria2P23819 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gria2P23819 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gria2P23819 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gria2P23819 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gria2P23819 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gria2P23819 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gria2P23819 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gria2P23819 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gria2P23819 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gria2P23819 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gria2P23819 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gria2P23819 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gria2P23819 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gria2P23819 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gria2P23819 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gria2P23819 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gria2P23819 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gria2P23819 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gria2P23819 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gria2P23819 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gria2P23819 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gria2P23819 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gria2P23819 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gria2P23819 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gria2P23819 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gria2P23819 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gria2P23819 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gria2P23819 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gria2P23819 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gria2P23819 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gria2P23819 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gria2P23819 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gria2P23819 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gria2P23819 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gria2P23819 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gria2P23819 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gria2P23819 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gria2P23819 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gria2P23819 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gria2P23819 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gria2P23819 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gria2P23819 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gria2P23819 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gria2P23819 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gria2P23819 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gria2P23819 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gria2P23819 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gria2P23819 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gria2P23819 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gria2P23819 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gria2P23819 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gria2P23819 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gria2P23819 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gria2P23819 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gria2P23819 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gria2P23819 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gria2P23819 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gria2P23819 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gria2P23819 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gria2P23819 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gria2P23819 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gria2P23819 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gria2P23819 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gria2P23819 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gria2P23819 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gria2P23819 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gria2P23819 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gria2P23819 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gria2P23819 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gria2P23819 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gria2P23819 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms