Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkchP23298 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkchP23298 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkchP23298 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkchP23298 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkchP23298 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkchP23298 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkchP23298 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkchP23298 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkchP23298 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkchP23298 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkchP23298 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkchP23298 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkchP23298 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkchP23298 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkchP23298 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkchP23298 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkchP23298 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkchP23298 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkchP23298 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkchP23298 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkchP23298 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkchP23298 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkchP23298 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkchP23298 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkchP23298 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkchP23298 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkchP23298 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkchP23298 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkchP23298 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkchP23298 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkchP23298 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkchP23298 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkchP23298 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkchP23298 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkchP23298 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkchP23298 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PrkchP23298 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkchP23298 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkchP23298 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkchP23298 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkchP23298 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkchP23298 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkchP23298 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkchP23298 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkchP23298 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkchP23298 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkchP23298 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkchP23298 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkchP23298 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkchP23298 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkchP23298 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkchP23298 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkchP23298 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkchP23298 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkchP23298 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkchP23298 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkchP23298 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkchP23298 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkchP23298 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkchP23298 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkchP23298 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkchP23298 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrkchP23298 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkchP23298 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkchP23298 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkchP23298 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkchP23298 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkchP23298 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkchP23298 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkchP23298 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkchP23298 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkchP23298 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkchP23298 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkchP23298 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkchP23298 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkchP23298 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkchP23298 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkchP23298 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkchP23298 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkchP23298 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkchP23298 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkchP23298 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkchP23298 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkchP23298 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkchP23298 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkchP23298 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkchP23298 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkchP23298 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkchP23298 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkchP23298 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms