Protein–RNA interactions for Protein: P19001

Krt19, Keratin, type I cytoskeletal 19, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt19P19001 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt19P19001 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt19P19001 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt19P19001 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt19P19001 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt19P19001 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt19P19001 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt19P19001 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt19P19001 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt19P19001 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt19P19001 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt19P19001 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt19P19001 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt19P19001 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt19P19001 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt19P19001 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt19P19001 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt19P19001 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt19P19001 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt19P19001 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt19P19001 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt19P19001 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt19P19001 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt19P19001 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt19P19001 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt19P19001 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt19P19001 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt19P19001 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt19P19001 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt19P19001 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt19P19001 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt19P19001 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt19P19001 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt19P19001 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt19P19001 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt19P19001 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt19P19001 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt19P19001 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt19P19001 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt19P19001 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt19P19001 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt19P19001 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt19P19001 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt19P19001 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt19P19001 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt19P19001 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt19P19001 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt19P19001 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt19P19001 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt19P19001 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt19P19001 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt19P19001 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt19P19001 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt19P19001 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt19P19001 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt19P19001 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt19P19001 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt19P19001 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt19P19001 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt19P19001 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt19P19001 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt19P19001 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt19P19001 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt19P19001 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt19P19001 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt19P19001 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt19P19001 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt19P19001 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms