Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18524 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18524 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18524 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18524 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18524 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18524 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18524 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18524 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18524 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18524 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18524 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18524 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18524 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P18524 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P18524 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P18524 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P18524 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P18524 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
P18524 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P18524 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
P18524 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P18524 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P18524 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18524 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18524 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18524 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18524 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18524 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18524 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18524 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P18524 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P18524 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P18524 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P18524 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P18524 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P18524 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P18524 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P18524 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P18524 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P18524 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P18524 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P18524 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P18524 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P18524 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P18524 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P18524 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P18524 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P18524 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P18524 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P18524 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P18524 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18524 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
P18524 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18524 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18524 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18524 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18524 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18524 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18524 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18524 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18524 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18524 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P18524 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P18524 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
P18524 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P18524 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P18524 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P18524 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P18524 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P18524 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P18524 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P18524 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P18524 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P18524 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P18524 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P18524 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P18524 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P18524 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P18524 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P18524 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P18524 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P18524 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P18524 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P18524 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
P18524 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P18524 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P18524 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P18524 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P18524 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
P18524 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P18524 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P18524 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P18524 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P18524 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P18524 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P18524 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P18524 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P18524 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
P18524 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms