Protein–RNA interactions for Protein: P16301

Lcat, Phosphatidylcholine-sterol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcatP16301 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LcatP16301 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LcatP16301 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LcatP16301 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LcatP16301 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LcatP16301 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LcatP16301 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LcatP16301 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LcatP16301 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LcatP16301 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LcatP16301 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LcatP16301 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LcatP16301 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LcatP16301 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LcatP16301 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LcatP16301 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LcatP16301 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LcatP16301 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LcatP16301 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LcatP16301 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LcatP16301 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LcatP16301 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LcatP16301 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LcatP16301 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LcatP16301 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LcatP16301 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LcatP16301 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LcatP16301 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LcatP16301 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LcatP16301 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LcatP16301 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LcatP16301 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LcatP16301 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LcatP16301 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LcatP16301 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LcatP16301 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LcatP16301 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LcatP16301 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LcatP16301 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LcatP16301 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LcatP16301 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LcatP16301 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LcatP16301 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LcatP16301 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LcatP16301 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LcatP16301 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LcatP16301 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LcatP16301 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LcatP16301 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LcatP16301 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LcatP16301 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LcatP16301 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LcatP16301 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LcatP16301 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LcatP16301 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LcatP16301 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LcatP16301 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LcatP16301 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LcatP16301 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LcatP16301 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LcatP16301 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LcatP16301 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LcatP16301 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LcatP16301 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LcatP16301 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LcatP16301 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LcatP16301 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LcatP16301 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LcatP16301 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LcatP16301 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LcatP16301 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LcatP16301 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LcatP16301 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LcatP16301 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LcatP16301 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LcatP16301 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LcatP16301 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LcatP16301 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LcatP16301 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LcatP16301 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LcatP16301 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LcatP16301 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LcatP16301 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LcatP16301 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LcatP16301 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LcatP16301 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LcatP16301 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LcatP16301 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LcatP16301 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LcatP16301 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LcatP16301 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LcatP16301 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LcatP16301 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LcatP16301 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LcatP16301 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LcatP16301 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LcatP16301 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LcatP16301 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LcatP16301 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LcatP16301 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms