Protein–RNA interactions for Protein: P16294

F9, Coagulation factor IX, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P16294 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F9P16294 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F9P16294 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F9P16294 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F9P16294 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F9P16294 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F9P16294 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
F9P16294 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
F9P16294 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F9P16294 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
F9P16294 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
F9P16294 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
F9P16294 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
F9P16294 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
F9P16294 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
F9P16294 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
F9P16294 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
F9P16294 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
F9P16294 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
F9P16294 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
F9P16294 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
F9P16294 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
F9P16294 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
F9P16294 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
F9P16294 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
F9P16294 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
F9P16294 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
F9P16294 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
F9P16294 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
F9P16294 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
F9P16294 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
F9P16294 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
F9P16294 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
F9P16294 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
F9P16294 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
F9P16294 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
F9P16294 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
F9P16294 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
F9P16294 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
F9P16294 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
F9P16294 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
F9P16294 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
F9P16294 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
F9P16294 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
F9P16294 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
F9P16294 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
F9P16294 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
F9P16294 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
F9P16294 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
F9P16294 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
F9P16294 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
F9P16294 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
F9P16294 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
F9P16294 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
F9P16294 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
F9P16294 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
F9P16294 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
F9P16294 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
F9P16294 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
F9P16294 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
F9P16294 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
F9P16294 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
F9P16294 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
F9P16294 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
F9P16294 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
F9P16294 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
F9P16294 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
F9P16294 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
F9P16294 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
F9P16294 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
F9P16294 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
F9P16294 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
F9P16294 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F9P16294 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F9P16294 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
F9P16294 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F9P16294 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F9P16294 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F9P16294 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
F9P16294 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F9P16294 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F9P16294 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
F9P16294 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
F9P16294 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
F9P16294 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
F9P16294 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F9P16294 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F9P16294 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F9P16294 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
F9P16294 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
F9P16294 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
F9P16294 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
F9P16294 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
F9P16294 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
F9P16294 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
F9P16294 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
F9P16294 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
F9P16294 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
F9P16294 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
F9P16294 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms