Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SptbP15508 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SptbP15508 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SptbP15508 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SptbP15508 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SptbP15508 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SptbP15508 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SptbP15508 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SptbP15508 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SptbP15508 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SptbP15508 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SptbP15508 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SptbP15508 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SptbP15508 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SptbP15508 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SptbP15508 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SptbP15508 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SptbP15508 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SptbP15508 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SptbP15508 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SptbP15508 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SptbP15508 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SptbP15508 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SptbP15508 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SptbP15508 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SptbP15508 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SptbP15508 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SptbP15508 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SptbP15508 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SptbP15508 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SptbP15508 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SptbP15508 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SptbP15508 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SptbP15508 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SptbP15508 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SptbP15508 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SptbP15508 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SptbP15508 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SptbP15508 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SptbP15508 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SptbP15508 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SptbP15508 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SptbP15508 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SptbP15508 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SptbP15508 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SptbP15508 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SptbP15508 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SptbP15508 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SptbP15508 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SptbP15508 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SptbP15508 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SptbP15508 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SptbP15508 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SptbP15508 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SptbP15508 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SptbP15508 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SptbP15508 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SptbP15508 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SptbP15508 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SptbP15508 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SptbP15508 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SptbP15508 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SptbP15508 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SptbP15508 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SptbP15508 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SptbP15508 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SptbP15508 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SptbP15508 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SptbP15508 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SptbP15508 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SptbP15508 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SptbP15508 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SptbP15508 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SptbP15508 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SptbP15508 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SptbP15508 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SptbP15508 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SptbP15508 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SptbP15508 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SptbP15508 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SptbP15508 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SptbP15508 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SptbP15508 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SptbP15508 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SptbP15508 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SptbP15508 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SptbP15508 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SptbP15508 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SptbP15508 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SptbP15508 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SptbP15508 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SptbP15508 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SptbP15508 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SptbP15508 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SptbP15508 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SptbP15508 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SptbP15508 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SptbP15508 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SptbP15508 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SptbP15508 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms