Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrphP15331 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrphP15331 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrphP15331 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrphP15331 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrphP15331 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PrphP15331 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrphP15331 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PrphP15331 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrphP15331 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrphP15331 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrphP15331 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrphP15331 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrphP15331 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrphP15331 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrphP15331 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrphP15331 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrphP15331 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrphP15331 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrphP15331 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrphP15331 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PrphP15331 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrphP15331 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrphP15331 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PrphP15331 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrphP15331 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrphP15331 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PrphP15331 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PrphP15331 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrphP15331 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PrphP15331 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrphP15331 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrphP15331 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrphP15331 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrphP15331 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrphP15331 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrphP15331 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrphP15331 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrphP15331 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrphP15331 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrphP15331 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrphP15331 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrphP15331 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrphP15331 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PrphP15331 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrphP15331 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrphP15331 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrphP15331 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrphP15331 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrphP15331 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrphP15331 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrphP15331 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrphP15331 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrphP15331 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrphP15331 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrphP15331 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrphP15331 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrphP15331 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrphP15331 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrphP15331 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrphP15331 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrphP15331 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrphP15331 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrphP15331 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrphP15331 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrphP15331 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrphP15331 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrphP15331 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrphP15331 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PrphP15331 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrphP15331 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrphP15331 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrphP15331 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrphP15331 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PrphP15331 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrphP15331 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrphP15331 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrphP15331 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrphP15331 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrphP15331 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrphP15331 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrphP15331 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrphP15331 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrphP15331 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrphP15331 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrphP15331 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrphP15331 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrphP15331 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrphP15331 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrphP15331 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrphP15331 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrphP15331 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PrphP15331 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PrphP15331 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrphP15331 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrphP15331 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrphP15331 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrphP15331 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrphP15331 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrphP15331 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms