Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrphP15331 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrphP15331 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrphP15331 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrphP15331 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrphP15331 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PrphP15331 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrphP15331 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PrphP15331 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrphP15331 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrphP15331 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrphP15331 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrphP15331 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrphP15331 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrphP15331 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrphP15331 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrphP15331 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrphP15331 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrphP15331 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrphP15331 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrphP15331 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PrphP15331 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrphP15331 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrphP15331 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PrphP15331 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrphP15331 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrphP15331 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PrphP15331 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PrphP15331 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrphP15331 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PrphP15331 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrphP15331 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrphP15331 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrphP15331 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrphP15331 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrphP15331 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrphP15331 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrphP15331 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrphP15331 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrphP15331 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrphP15331 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrphP15331 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrphP15331 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrphP15331 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PrphP15331 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrphP15331 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrphP15331 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrphP15331 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrphP15331 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrphP15331 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrphP15331 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrphP15331 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrphP15331 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrphP15331 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrphP15331 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrphP15331 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrphP15331 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrphP15331 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrphP15331 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrphP15331 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrphP15331 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrphP15331 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrphP15331 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrphP15331 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrphP15331 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrphP15331 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrphP15331 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrphP15331 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrphP15331 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PrphP15331 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrphP15331 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrphP15331 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrphP15331 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrphP15331 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PrphP15331 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrphP15331 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrphP15331 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrphP15331 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrphP15331 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrphP15331 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrphP15331 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrphP15331 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrphP15331 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrphP15331 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrphP15331 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrphP15331 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrphP15331 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrphP15331 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrphP15331 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrphP15331 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrphP15331 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrphP15331 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PrphP15331 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PrphP15331 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrphP15331 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrphP15331 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrphP15331 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrphP15331 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrphP15331 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrphP15331 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms