Protein–RNA interactions for Protein: P13595

Ncam1, Neural cell adhesion molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncam1P13595 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ncam1P13595 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ncam1P13595 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ncam1P13595 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ncam1P13595 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncam1P13595 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncam1P13595 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncam1P13595 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncam1P13595 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncam1P13595 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncam1P13595 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncam1P13595 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncam1P13595 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncam1P13595 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncam1P13595 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncam1P13595 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncam1P13595 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncam1P13595 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncam1P13595 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncam1P13595 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ncam1P13595 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncam1P13595 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncam1P13595 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncam1P13595 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncam1P13595 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncam1P13595 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncam1P13595 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncam1P13595 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncam1P13595 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncam1P13595 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncam1P13595 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncam1P13595 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncam1P13595 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncam1P13595 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncam1P13595 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncam1P13595 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncam1P13595 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncam1P13595 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncam1P13595 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncam1P13595 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncam1P13595 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncam1P13595 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncam1P13595 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncam1P13595 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncam1P13595 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncam1P13595 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncam1P13595 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncam1P13595 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncam1P13595 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncam1P13595 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncam1P13595 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncam1P13595 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncam1P13595 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncam1P13595 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncam1P13595 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncam1P13595 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncam1P13595 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncam1P13595 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncam1P13595 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncam1P13595 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncam1P13595 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms