Protein–RNA interactions for Protein: P13562

Gnrh1, Progonadoliberin-1, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnrh1P13562 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gnrh1P13562 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gnrh1P13562 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gnrh1P13562 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gnrh1P13562 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gnrh1P13562 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gnrh1P13562 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gnrh1P13562 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gnrh1P13562 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gnrh1P13562 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gnrh1P13562 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gnrh1P13562 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gnrh1P13562 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gnrh1P13562 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gnrh1P13562 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gnrh1P13562 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gnrh1P13562 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gnrh1P13562 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gnrh1P13562 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gnrh1P13562 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gnrh1P13562 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gnrh1P13562 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gnrh1P13562 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gnrh1P13562 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gnrh1P13562 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gnrh1P13562 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gnrh1P13562 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gnrh1P13562 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gnrh1P13562 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gnrh1P13562 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gnrh1P13562 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gnrh1P13562 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gnrh1P13562 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gnrh1P13562 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gnrh1P13562 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gnrh1P13562 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gnrh1P13562 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gnrh1P13562 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gnrh1P13562 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gnrh1P13562 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gnrh1P13562 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gnrh1P13562 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gnrh1P13562 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gnrh1P13562 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gnrh1P13562 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gnrh1P13562 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gnrh1P13562 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Gnrh1P13562 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gnrh1P13562 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gnrh1P13562 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gnrh1P13562 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gnrh1P13562 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gnrh1P13562 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gnrh1P13562 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gnrh1P13562 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gnrh1P13562 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gnrh1P13562 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gnrh1P13562 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gnrh1P13562 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gnrh1P13562 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gnrh1P13562 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gnrh1P13562 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gnrh1P13562 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gnrh1P13562 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gnrh1P13562 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gnrh1P13562 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gnrh1P13562 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gnrh1P13562 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gnrh1P13562 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gnrh1P13562 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gnrh1P13562 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms