Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd5P13379 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd5P13379 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd5P13379 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd5P13379 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd5P13379 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd5P13379 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd5P13379 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd5P13379 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd5P13379 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd5P13379 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd5P13379 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd5P13379 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd5P13379 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd5P13379 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd5P13379 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd5P13379 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd5P13379 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd5P13379 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd5P13379 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd5P13379 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd5P13379 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd5P13379 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd5P13379 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd5P13379 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd5P13379 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd5P13379 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd5P13379 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd5P13379 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd5P13379 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms