Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nr4a1P12813 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nr4a1P12813 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nr4a1P12813 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nr4a1P12813 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nr4a1P12813 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nr4a1P12813 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nr4a1P12813 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nr4a1P12813 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nr4a1P12813 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nr4a1P12813 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nr4a1P12813 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nr4a1P12813 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nr4a1P12813 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nr4a1P12813 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nr4a1P12813 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nr4a1P12813 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nr4a1P12813 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nr4a1P12813 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nr4a1P12813 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nr4a1P12813 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nr4a1P12813 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nr4a1P12813 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nr4a1P12813 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Nr4a1P12813 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nr4a1P12813 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nr4a1P12813 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nr4a1P12813 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms