Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxcl2P10889 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcl2P10889 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cxcl2P10889 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms