Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprqP0C5E4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprqP0C5E4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprqP0C5E4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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