Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Surf1P09925 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Surf1P09925 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Surf1P09925 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Surf1P09925 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Surf1P09925 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Surf1P09925 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Surf1P09925 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Surf1P09925 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Surf1P09925 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Surf1P09925 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Surf1P09925 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Surf1P09925 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Surf1P09925 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Surf1P09925 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Surf1P09925 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Surf1P09925 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Surf1P09925 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Surf1P09925 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Surf1P09925 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Surf1P09925 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Surf1P09925 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Surf1P09925 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Surf1P09925 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Surf1P09925 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Surf1P09925 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Surf1P09925 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Surf1P09925 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Surf1P09925 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Surf1P09925 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Surf1P09925 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Surf1P09925 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Surf1P09925 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Surf1P09925 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Surf1P09925 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Surf1P09925 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Surf1P09925 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Surf1P09925 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Surf1P09925 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Surf1P09925 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Surf1P09925 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Surf1P09925 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Surf1P09925 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Surf1P09925 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Surf1P09925 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Surf1P09925 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Surf1P09925 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Surf1P09925 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Surf1P09925 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Surf1P09925 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Surf1P09925 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Surf1P09925 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Surf1P09925 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Surf1P09925 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Surf1P09925 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Surf1P09925 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Surf1P09925 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Surf1P09925 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Surf1P09925 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Surf1P09925 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Surf1P09925 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Surf1P09925 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Surf1P09925 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Surf1P09925 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Surf1P09925 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms