Protein–RNA interactions for Protein: P09803

Cdh1, Cadherin-1, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh1P09803 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh1P09803 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh1P09803 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh1P09803 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh1P09803 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh1P09803 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh1P09803 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh1P09803 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh1P09803 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh1P09803 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh1P09803 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh1P09803 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh1P09803 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh1P09803 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh1P09803 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh1P09803 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh1P09803 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh1P09803 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh1P09803 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh1P09803 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh1P09803 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh1P09803 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh1P09803 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh1P09803 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdh1P09803 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh1P09803 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh1P09803 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh1P09803 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh1P09803 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh1P09803 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh1P09803 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh1P09803 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh1P09803 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh1P09803 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh1P09803 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh1P09803 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh1P09803 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh1P09803 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh1P09803 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh1P09803 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh1P09803 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh1P09803 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh1P09803 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh1P09803 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh1P09803 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh1P09803 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh1P09803 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh1P09803 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh1P09803 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh1P09803 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh1P09803 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh1P09803 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdh1P09803 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdh1P09803 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdh1P09803 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh1P09803 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh1P09803 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh1P09803 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh1P09803 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh1P09803 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh1P09803 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh1P09803 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh1P09803 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh1P09803 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh1P09803 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh1P09803 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh1P09803 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh1P09803 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh1P09803 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh1P09803 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh1P09803 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh1P09803 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh1P09803 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms