Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna5P07349 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ifna5P07349 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms