Protein–RNA interactions for Protein: P01915

H-2 class II histocompatibility antigen, E-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01915 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P01915 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01915 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01915 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01915 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01915 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01915 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01915 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01915 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01915 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01915 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01915 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01915 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01915 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01915 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01915 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01915 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01915 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01915 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01915 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01915 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01915 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01915 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01915 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01915 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01915 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01915 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01915 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01915 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01915 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01915 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01915 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01915 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01915 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01915 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01915 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01915 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01915 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01915 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01915 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P01915 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01915 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01915 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01915 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01915 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01915 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01915 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01915 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01915 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01915 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01915 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01915 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01915 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01915 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01915 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01915 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01915 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01915 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01915 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01915 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01915 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01915 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01915 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01915 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01915 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01915 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01915 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01915 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01915 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01915 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01915 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01915 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01915 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01915 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01915 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01915 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01915 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01915 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01915 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
P01915 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01915 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01915 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01915 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01915 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01915 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01915 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01915 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01915 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01915 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
P01915 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01915 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01915 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01915 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01915 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01915 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01915 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01915 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01915 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01915 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
P01915 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 209.9 ms