Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
H2-K1P01901 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-K1P01901 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-K1P01901 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-K1P01901 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-K1P01901 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-K1P01901 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-K1P01901 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-K1P01901 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-K1P01901 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-K1P01901 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-K1P01901 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-K1P01901 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-K1P01901 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-K1P01901 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-K1P01901 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-K1P01901 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-K1P01901 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-K1P01901 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-K1P01901 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-K1P01901 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-K1P01901 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-K1P01901 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-K1P01901 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-K1P01901 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H2-K1P01901 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-K1P01901 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2-K1P01901 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2-K1P01901 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2-K1P01901 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-K1P01901 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-K1P01901 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-K1P01901 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-K1P01901 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-K1P01901 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-K1P01901 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-K1P01901 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-K1P01901 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-K1P01901 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-K1P01901 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-K1P01901 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-K1P01901 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-K1P01901 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms