Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01747 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01747 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01747 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01747 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01747 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01747 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01747 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01747 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01747 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01747 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01747 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01747 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01747 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01747 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01747 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01747 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01747 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01747 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01747 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01747 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01747 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01747 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01747 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01747 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01747 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01747 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01747 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01747 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01747 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01747 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01747 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01747 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01747 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01747 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01747 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01747 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01747 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01747 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01747 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01747 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01747 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01747 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01747 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01747 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01747 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01747 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01747 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01747 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01747 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01747 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01747 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01747 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01747 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01747 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01747 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01747 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01747 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01747 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01747 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01747 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01747 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01747 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01747 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01747 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01747 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01747 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01747 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01747 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01747 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01747 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01747 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01747 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01747 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01747 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01747 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01747 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01747 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01747 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01747 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01747 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01747 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01747 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01747 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01747 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01747 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01747 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01747 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01747 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01747 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01747 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01747 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01747 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01747 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01747 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01747 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01747 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01747 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01747 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01747 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms