Protein–RNA interactions for Protein: P01736

T-cell receptor beta chain V region PHDS203 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01736 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01736 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01736 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01736 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01736 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01736 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01736 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01736 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01736 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01736 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01736 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01736 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01736 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01736 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01736 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01736 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01736 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01736 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01736 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01736 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01736 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01736 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01736 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01736 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01736 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01736 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01736 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01736 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01736 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01736 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01736 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01736 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01736 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01736 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01736 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01736 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01736 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01736 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P01736 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01736 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01736 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01736 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01736 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01736 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01736 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01736 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01736 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01736 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01736 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01736 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01736 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01736 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01736 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01736 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01736 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01736 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01736 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01736 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01736 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01736 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01736 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01736 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01736 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01736 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01736 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01736 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01736 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01736 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01736 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01736 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01736 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01736 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01736 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01736 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01736 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01736 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01736 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01736 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01736 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01736 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01736 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01736 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01736 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01736 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01736 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01736 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01736 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01736 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01736 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01736 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01736 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01736 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01736 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01736 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01736 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01736 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01736 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01736 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01736 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01736 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms