Protein–RNA interactions for Protein: P01726

Ig lambda-1 chain V region H2020, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01726 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01726 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01726 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01726 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01726 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01726 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
P01726 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01726 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01726 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01726 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01726 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01726 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01726 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01726 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01726 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01726 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01726 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01726 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01726 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01726 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01726 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01726 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01726 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01726 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01726 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01726 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01726 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01726 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01726 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01726 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01726 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01726 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01726 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01726 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01726 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01726 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01726 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01726 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01726 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P01726 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01726 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01726 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01726 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01726 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01726 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
P01726 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01726 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01726 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01726 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01726 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01726 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P01726 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01726 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01726 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
P01726 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01726 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01726 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01726 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01726 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01726 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
P01726 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01726 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01726 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01726 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01726 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01726 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01726 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01726 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01726 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01726 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01726 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01726 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01726 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01726 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01726 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01726 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01726 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
P01726 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01726 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01726 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01726 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01726 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01726 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01726 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01726 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01726 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01726 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
P01726 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01726 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01726 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01726 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01726 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01726 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01726 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01726 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01726 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01726 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01726 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01726 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01726 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms