Protein–RNA interactions for Protein: P01643

Ig kappa chain V-V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01643 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01643 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01643 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01643 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01643 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01643 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01643 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01643 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01643 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01643 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01643 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01643 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01643 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01643 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01643 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01643 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01643 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01643 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01643 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
P01643 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01643 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01643 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01643 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01643 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01643 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01643 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01643 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01643 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01643 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01643 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01643 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01643 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01643 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01643 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01643 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01643 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01643 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01643 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01643 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01643 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01643 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01643 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01643 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01643 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01643 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01643 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01643 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01643 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01643 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01643 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
P01643 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01643 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01643 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01643 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01643 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01643 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01643 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01643 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01643 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01643 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01643 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
P01643 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01643 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01643 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01643 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01643 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01643 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01643 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01643 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01643 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01643 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01643 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01643 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01643 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01643 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01643 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01643 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01643 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01643 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01643 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01643 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01643 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01643 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01643 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
P01643 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01643 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01643 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01643 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01643 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01643 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01643 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01643 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01643 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01643 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P01643 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01643 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01643 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01643 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01643 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01643 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms