Protein–RNA interactions for Protein: P00184

Cyp1a1, Cytochrome P450 1A1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp1a1P00184 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp1a1P00184 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp1a1P00184 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp1a1P00184 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp1a1P00184 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cyp1a1P00184 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp1a1P00184 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp1a1P00184 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms