Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vti1aO89116 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vti1aO89116 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vti1aO89116 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vti1aO89116 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vti1aO89116 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vti1aO89116 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vti1aO89116 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vti1aO89116 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vti1aO89116 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vti1aO89116 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vti1aO89116 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vti1aO89116 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vti1aO89116 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vti1aO89116 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vti1aO89116 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vti1aO89116 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vti1aO89116 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vti1aO89116 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vti1aO89116 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vti1aO89116 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vti1aO89116 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Vti1aO89116 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vti1aO89116 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vti1aO89116 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vti1aO89116 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vti1aO89116 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vti1aO89116 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vti1aO89116 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vti1aO89116 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vti1aO89116 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vti1aO89116 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vti1aO89116 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vti1aO89116 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vti1aO89116 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vti1aO89116 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vti1aO89116 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vti1aO89116 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vti1aO89116 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vti1aO89116 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms