Protein–RNA interactions for Protein: O89032

Sh3pxd2a, SH3 and PX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2aO89032 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3pxd2aO89032 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3pxd2aO89032 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3pxd2aO89032 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3pxd2aO89032 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3pxd2aO89032 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3pxd2aO89032 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3pxd2aO89032 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3pxd2aO89032 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3pxd2aO89032 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3pxd2aO89032 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3pxd2aO89032 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3pxd2aO89032 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3pxd2aO89032 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3pxd2aO89032 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3pxd2aO89032 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3pxd2aO89032 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3pxd2aO89032 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sh3pxd2aO89032 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sh3pxd2aO89032 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sh3pxd2aO89032 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3pxd2aO89032 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3pxd2aO89032 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3pxd2aO89032 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3pxd2aO89032 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3pxd2aO89032 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3pxd2aO89032 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3pxd2aO89032 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3pxd2aO89032 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3pxd2aO89032 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3pxd2aO89032 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3pxd2aO89032 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3pxd2aO89032 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3pxd2aO89032 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3pxd2aO89032 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3pxd2aO89032 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3pxd2aO89032 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3pxd2aO89032 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3pxd2aO89032 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3pxd2aO89032 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3pxd2aO89032 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3pxd2aO89032 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3pxd2aO89032 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3pxd2aO89032 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms