Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CpdO89001 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CpdO89001 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CpdO89001 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CpdO89001 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CpdO89001 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CpdO89001 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CpdO89001 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CpdO89001 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CpdO89001 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CpdO89001 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CpdO89001 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CpdO89001 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CpdO89001 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CpdO89001 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CpdO89001 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CpdO89001 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CpdO89001 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CpdO89001 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CpdO89001 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CpdO89001 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CpdO89001 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CpdO89001 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CpdO89001 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CpdO89001 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CpdO89001 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CpdO89001 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CpdO89001 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CpdO89001 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CpdO89001 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CpdO89001 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CpdO89001 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CpdO89001 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CpdO89001 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CpdO89001 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CpdO89001 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CpdO89001 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CpdO89001 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CpdO89001 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CpdO89001 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CpdO89001 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CpdO89001 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CpdO89001 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CpdO89001 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CpdO89001 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CpdO89001 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CpdO89001 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CpdO89001 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CpdO89001 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CpdO89001 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CpdO89001 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CpdO89001 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CpdO89001 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CpdO89001 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CpdO89001 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CpdO89001 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CpdO89001 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CpdO89001 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CpdO89001 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CpdO89001 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CpdO89001 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CpdO89001 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CpdO89001 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CpdO89001 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CpdO89001 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CpdO89001 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CpdO89001 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CpdO89001 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CpdO89001 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CpdO89001 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CpdO89001 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CpdO89001 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CpdO89001 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CpdO89001 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CpdO89001 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CpdO89001 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CpdO89001 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CpdO89001 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CpdO89001 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CpdO89001 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CpdO89001 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CpdO89001 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CpdO89001 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CpdO89001 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CpdO89001 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CpdO89001 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CpdO89001 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CpdO89001 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CpdO89001 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CpdO89001 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CpdO89001 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CpdO89001 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CpdO89001 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CpdO89001 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CpdO89001 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CpdO89001 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CpdO89001 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CpdO89001 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CpdO89001 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CpdO89001 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms