Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Setdb1O88974 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Setdb1O88974 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Setdb1O88974 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Setdb1O88974 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Setdb1O88974 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Setdb1O88974 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Setdb1O88974 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Setdb1O88974 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Setdb1O88974 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Setdb1O88974 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Setdb1O88974 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Setdb1O88974 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Setdb1O88974 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Setdb1O88974 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Setdb1O88974 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Setdb1O88974 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Setdb1O88974 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Setdb1O88974 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Setdb1O88974 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Setdb1O88974 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Setdb1O88974 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Setdb1O88974 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Setdb1O88974 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Setdb1O88974 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Setdb1O88974 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Setdb1O88974 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Setdb1O88974 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Setdb1O88974 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Setdb1O88974 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Setdb1O88974 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Setdb1O88974 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Setdb1O88974 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Setdb1O88974 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Setdb1O88974 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Setdb1O88974 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Setdb1O88974 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Setdb1O88974 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Setdb1O88974 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Setdb1O88974 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Setdb1O88974 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Setdb1O88974 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Setdb1O88974 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Setdb1O88974 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Setdb1O88974 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Setdb1O88974 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Setdb1O88974 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Setdb1O88974 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Setdb1O88974 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Setdb1O88974 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Setdb1O88974 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Setdb1O88974 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Setdb1O88974 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Setdb1O88974 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Setdb1O88974 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Setdb1O88974 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Setdb1O88974 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Setdb1O88974 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Setdb1O88974 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Setdb1O88974 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setdb1O88974 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setdb1O88974 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setdb1O88974 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Setdb1O88974 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Setdb1O88974 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Setdb1O88974 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Setdb1O88974 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms