Protein–RNA interactions for Protein: O88809

Dcx, Neuronal migration protein doublecortin, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcxO88809 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DcxO88809 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DcxO88809 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DcxO88809 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DcxO88809 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DcxO88809 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DcxO88809 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DcxO88809 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DcxO88809 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DcxO88809 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DcxO88809 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DcxO88809 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DcxO88809 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DcxO88809 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DcxO88809 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DcxO88809 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DcxO88809 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DcxO88809 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DcxO88809 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DcxO88809 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DcxO88809 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DcxO88809 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DcxO88809 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DcxO88809 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DcxO88809 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DcxO88809 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DcxO88809 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DcxO88809 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
DcxO88809 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DcxO88809 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DcxO88809 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DcxO88809 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DcxO88809 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DcxO88809 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DcxO88809 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DcxO88809 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DcxO88809 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DcxO88809 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DcxO88809 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DcxO88809 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DcxO88809 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DcxO88809 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DcxO88809 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DcxO88809 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DcxO88809 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DcxO88809 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DcxO88809 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DcxO88809 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DcxO88809 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DcxO88809 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DcxO88809 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DcxO88809 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DcxO88809 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DcxO88809 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DcxO88809 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DcxO88809 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DcxO88809 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DcxO88809 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DcxO88809 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DcxO88809 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DcxO88809 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DcxO88809 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DcxO88809 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DcxO88809 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DcxO88809 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DcxO88809 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DcxO88809 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DcxO88809 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DcxO88809 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DcxO88809 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DcxO88809 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DcxO88809 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DcxO88809 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DcxO88809 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DcxO88809 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DcxO88809 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DcxO88809 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DcxO88809 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DcxO88809 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DcxO88809 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DcxO88809 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DcxO88809 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DcxO88809 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DcxO88809 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DcxO88809 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DcxO88809 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DcxO88809 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DcxO88809 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DcxO88809 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DcxO88809 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DcxO88809 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DcxO88809 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DcxO88809 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DcxO88809 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DcxO88809 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DcxO88809 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DcxO88809 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DcxO88809 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DcxO88809 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DcxO88809 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms