Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pak1O88643 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pak1O88643 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pak1O88643 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pak1O88643 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pak1O88643 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pak1O88643 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pak1O88643 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pak1O88643 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pak1O88643 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pak1O88643 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pak1O88643 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pak1O88643 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pak1O88643 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pak1O88643 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pak1O88643 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pak1O88643 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pak1O88643 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pak1O88643 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pak1O88643 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pak1O88643 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pak1O88643 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pak1O88643 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pak1O88643 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pak1O88643 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pak1O88643 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pak1O88643 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pak1O88643 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pak1O88643 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pak1O88643 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pak1O88643 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pak1O88643 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pak1O88643 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pak1O88643 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pak1O88643 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pak1O88643 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pak1O88643 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pak1O88643 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pak1O88643 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pak1O88643 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Pak1O88643 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pak1O88643 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pak1O88643 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pak1O88643 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pak1O88643 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pak1O88643 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pak1O88643 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pak1O88643 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pak1O88643 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pak1O88643 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pak1O88643 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pak1O88643 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pak1O88643 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pak1O88643 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pak1O88643 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pak1O88643 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pak1O88643 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pak1O88643 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pak1O88643 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pak1O88643 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pak1O88643 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pak1O88643 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pak1O88643 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pak1O88643 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pak1O88643 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pak1O88643 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pak1O88643 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pak1O88643 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pak1O88643 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pak1O88643 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Pak1O88643 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pak1O88643 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pak1O88643 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms