Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc6a20bO88575 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc6a20bO88575 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc6a20bO88575 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc6a20bO88575 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc6a20bO88575 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc6a20bO88575 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc6a20bO88575 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc6a20bO88575 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slc6a20bO88575 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slc6a20bO88575 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc6a20bO88575 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc6a20bO88575 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc6a20bO88575 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc6a20bO88575 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc6a20bO88575 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc6a20bO88575 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc6a20bO88575 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc6a20bO88575 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc6a20bO88575 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc6a20bO88575 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc6a20bO88575 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc6a20bO88575 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc6a20bO88575 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc6a20bO88575 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc6a20bO88575 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc6a20bO88575 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc6a20bO88575 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc6a20bO88575 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc6a20bO88575 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc6a20bO88575 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc6a20bO88575 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc6a20bO88575 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc6a20bO88575 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc6a20bO88575 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc6a20bO88575 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc6a20bO88575 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc6a20bO88575 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc6a20bO88575 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc6a20bO88575 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc6a20bO88575 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc6a20bO88575 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc6a20bO88575 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc6a20bO88575 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc6a20bO88575 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc6a20bO88575 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc6a20bO88575 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc6a20bO88575 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc6a20bO88575 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc6a20bO88575 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc6a20bO88575 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc6a20bO88575 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc6a20bO88575 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc6a20bO88575 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc6a20bO88575 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Slc6a20bO88575 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc6a20bO88575 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc6a20bO88575 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc6a20bO88575 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc6a20bO88575 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc6a20bO88575 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc6a20bO88575 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc6a20bO88575 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc6a20bO88575 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc6a20bO88575 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc6a20bO88575 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc6a20bO88575 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc6a20bO88575 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc6a20bO88575 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc6a20bO88575 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc6a20bO88575 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms