Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnk4O88454 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnk4O88454 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnk4O88454 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnk4O88454 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnk4O88454 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnk4O88454 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnk4O88454 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnk4O88454 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnk4O88454 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnk4O88454 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnk4O88454 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnk4O88454 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnk4O88454 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnk4O88454 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnk4O88454 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnk4O88454 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnk4O88454 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnk4O88454 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnk4O88454 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnk4O88454 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnk4O88454 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnk4O88454 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnk4O88454 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnk4O88454 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnk4O88454 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnk4O88454 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnk4O88454 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kcnk4O88454 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnk4O88454 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnk4O88454 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnk4O88454 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnk4O88454 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnk4O88454 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnk4O88454 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnk4O88454 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnk4O88454 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnk4O88454 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnk4O88454 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnk4O88454 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnk4O88454 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnk4O88454 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnk4O88454 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnk4O88454 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnk4O88454 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnk4O88454 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnk4O88454 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnk4O88454 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnk4O88454 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnk4O88454 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnk4O88454 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnk4O88454 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnk4O88454 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnk4O88454 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms