Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnnal1O88327 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnnal1O88327 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnnal1O88327 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnnal1O88327 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnnal1O88327 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctnnal1O88327 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnnal1O88327 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnnal1O88327 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ctnnal1O88327 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ctnnal1O88327 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnnal1O88327 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctnnal1O88327 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctnnal1O88327 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctnnal1O88327 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctnnal1O88327 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctnnal1O88327 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctnnal1O88327 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctnnal1O88327 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnnal1O88327 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnnal1O88327 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnnal1O88327 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnnal1O88327 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctnnal1O88327 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctnnal1O88327 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctnnal1O88327 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctnnal1O88327 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnnal1O88327 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnnal1O88327 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnnal1O88327 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnnal1O88327 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnnal1O88327 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnnal1O88327 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnnal1O88327 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnnal1O88327 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnnal1O88327 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctnnal1O88327 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctnnal1O88327 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctnnal1O88327 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctnnal1O88327 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctnnal1O88327 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms